คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี แรกเริ่มเมื่อพุทธศักราช 2531 เปิดร่วมกับสถาบันภาษาและวัฒนธรรมในภาควิชาพื้นฐาน เพื่อให้บริการการสอนวิชาพื้นฐานทางวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์ ภาษาศาสตร์ มนุษย์ศาสตร์ และสังคมศาสตร์ ในนามภาควิชาพื้นฐาน วิทยาลัยอุบลราชธานี สังกัดมหาวิทยาลัยขอนแก่น และเปลี่ยนเป็นคณะวิทยาศาสตร์ เมื่อวันที่ 29 กรกฎาคม 2533