มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี ได้ก่อกำเนิดในลักษณะ วิทยาลัยอุบลราชธานี ในสังกัดมหาวิทยาลัยขอนแก่น เมื่อวันที่ 14 กันยายน 2530 และดำเนินการรับนักศึกษารุ่นแรก 2 สาขา คือ นักศึกษาคณะเกษตรศาสตร์ และนักศึกษาคณะวิศวกรรมศาสตร์ โดยจัดการเรียนการสอนในมหาวิทยาลัยขอนแก่น และต่อมาได้ย้ายสถานที่มาที่อำเภอวารินชำราบ จังหวัดอุบลราชธานี ที่ตั้งของมหาวิทยาลัยอุบลราชธานีในปัจจุบัน และวิทยาลัยอุบลราชธานี ได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยอุบลราชธานี ในราชกิจจานุเบกษา เมื่อวันที่ 29 กรกฎาคม 2533 โดยแบ่งส่วนราชการเป็นสำนักงานอธิการบดี คณะเกษตรศาสตร์ คณะวิศวกรรมศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ และสถาบันภาษาและวัฒนธรรม มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี มีโครงการที่จะขยายงานจัดการศึกษาไปยังด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพสาขาต่าง ๆ อันได้แก่เภสัชศาสตร์ แพทย์ศาสตร์เป็นต้น ทั้งนี้เพื่อแก้ปัญหาการขาดแคลน และปัญหาการกระจายตัวของบุคลากรด้านการแพทย์และสาธารณสุขของประเทศ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในภาคตะวันออกเฉียงเหนือเมื่อพิจารณาถึงความเร่งด่วน และคงามเป็นไปได้ในการจัดตั้งคณะวิชาด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพแล้ว มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี มีศักยภาพและความพร้อมที่จะจัดตั้งคณะเภสัชศาสตร์เป็นคณะแรก กอรปกับได้รับการสนับสนุนและความร่วมมือทางวิชาการเป็นอย่างดียิ่งจากคณะเภสัชศาสตร์สถาบันเดิมทั้ง 6 สถาบัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งจากมหาวิทยาลัยศิลปากร และมหาวิทยาลัยขอนแก่น และจากศูนย์ประสานงานการศึกษาเภสัชศาสตร์แห่งประเทศไทย (ศศภท.) และประการสำคัญคือ จังหวัดอุบลราชธานีเป็นเขตที่มีความพร้อมและศักยภาพในด้านต่าง ๆ เพียงพอที่จะสามารถสนับสนุนการศึกษาระดับอุดมศึกษาสาขาเภสัชศาสตร์ของทบวงมหาวิทยาลัยได้อย่างมีประสิทธิภาพ และเปี่ยมประสิทธิผล ทั้งนี้เนื่องจาก มีสถานบริการและหน่วยงานสาธารณสุขต่าง ๆ ตั้งอยู่ในเขตอุบลราชธานี  และจังหวัดใกล้เคียงจำนวนมาก ซึ่งให้บริการรักษาพยาบาลและดูแลสุขภาพอนามัยของประชาชน และสามารถเป็นแหล่งฝึกปฏิบัติงานของบุคลากรสาธารณสุขด้านต่าง ๆ ได้เป็นอย่างดี อาทิ โรงพยาบาลสรรพสิทธิประสงค์ ซึ่งเป็นโรงพยายบาลศูนย์ขนาด 900 เตียง โรงพยาบาลชุมชนในอำเภอต่าง ๆ จำนวน 32 แห่ง โรงพยาบาลพระศรีมหาพิ์ ซึ่งเป็นโรงพยาบาลจิตเวช และศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ เป็นต้น ดังนั้นมหาวิทยาลัยอุบลราชธานีได้เสนอ โครงการจัดตั้งคณะเภสัชศาสตร์ ไว้ในแผนพัฒนาการศึกษาระดับอุดมศึกษาระยะที่ 7  (พ.ศ. 2535-2539) นับเป็นคณะเภสัชศาสตร์ของรัฐ ลำดับที่ 8  และเป็นคณะวิชาทางด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพคณะแรกของมหาวิทยาลัยอุบลราชธานี โดยมีวัตถุประสงค์ของการจัดตั้งดังนี้ 1.เพื่อผลิจสาขาเภสัชศาสตร์ที่มีคุณภาพมาตรฐานกำหนด สนองความต้องการของประเทศทั้งภาครัฐและเอกชน และเป็นการช่วยปัญหาการขาดแคลนเภสัชกร โดยเฉพาะอย่างยิ่งในภูมิภาคตะวันออกเฉียงเหนือได้ในระดับหนึ่ง 2.เพื่อดำเนินการศึกษาค้นคว้าวิจัยและเผยแพร่ผลงานวิชาการทางด้านเภสัชศาสตร์ สาธารณสุขและวิทยาศาสตร์การแพทย์ในสาขาที่เกี่ยวข้อง เพื่อพัฒนาและแก้ปัญหาสาธารณสุขของชุมชนและของประเทศ 3.เพื่อดำเนินการศึกษาค้นคว้า วิจัยและพัฒนา ตลอดจนเผยแพร่ผลงานวิชาการทางด้านเทคโนโลยีเภสัชกรรม เภสัชเวทและสมุนไพร เพื่อการพี่งพาตนเองทางด้านเภสัชภัณฑ์ของประเทศ 4.เพื่อให้บริการวิชาการเภสัชศาสตร์แก่สังคม โดยการจัดอบรม ประชุม และสัมมนาทางวิชาการ การเผยแพร่ความรู้และบริการเภสัชสนเทศ แก่หน่วยงานต่าง ๆ ทั้งภาครัฐและเอกชนตลอดจนประชาชนทั่วไป 5.เพื่อทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรมด้านประวัติศาสตร์เภสัชกรรมไทย และการอนุรักษ์เภสัชตำรับดั้งเดิมของไทยไว้ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี…